●紫金矿业集团股份有限公司矿冶设计研究院（简称“矿冶院”）：是集团公司以科研为主从事研究与发展（R&D）的部门，其前身为成立于1999年8月福建省闽西紫金矿业集团有限公司技术研究中心。2000年10月被福建省经贸委等5部门认定为“福建省第四批省级企业技术中心”（闽经贸技术[2000]675号文，2000年9月7日发）。2006年1月被科技部确认为“国家级企业研究开发中心”（国科发高字[2006]14号，2006年1月9日发），2006年9月被国家发改委等5部门确认为“国家认定企业（集团）技术中心”（发改办高技[2006]879号文）。

矿冶院主要研究方向是：黄金及有色金属资源地质勘查、采矿、选矿、冶金、加工和生产领域中的技术难题；研究新工艺、新设备、新技术及具有重大商业价值的新材料，并促进其成功孵化和工程化；研究黄金及有色金属工业的前沿技术，特别是行业关键技术和共性技术（如难处理金矿和低品位含砷铜矿的湿法冶金技术）；研发纳米材料及新型粉体材料、复合材料。

●厦门紫金科技股份有限公司（简称“科技公司”）：于2001年2月15日设立，是集团公司设在厦门的研发基地、人才基地、科研成果产业化基地和对外拓展基地。2004年6月30日，被厦门市科学技术局认定为厦门市高新技术企业。拥有上杭金山建设工程有限公司、厦门紫金工程设计有限公司2家控股公司。

●厦门矿产地质勘查院（简称“地勘院”）：组建于2004年3月。其主要职能是负责集团公司风险勘探技术管理、矿权管理及资源/储量管理。内设综合处、地勘处和测试中心等3个机构。

●厦门紫金工程设计有限公司：设立于2004年5月。经营范围：建筑工程及相应工程咨询和装饰设计（乙级），冶金行业矿山、黄金冶炼设计（限企业内部）。

●东北亚矿产勘查开发分公司：成立于2005年1月18日，是总部派出分支机构，专门从事矿产资源的勘查工作。

●福建紫金矿冶测试技术有限公司：在集团公司实验室（隶属于矿冶院）的基础上于2006年7月24日注册设立的全资子公司。经营范围：从事黄金及其它有色/黑色金属矿和矿产品的检测、选冶试验研究及其技术服务。2006年取得了包括金银铜金属产品、岩矿样/化探样、多种有色/黑色金属矿产品和水质等28类258项检测计量认证资质，26类234项检测CNAS认可资质。

●厦门紫金矿冶技术有限公司公司：2006年10月设立，地处厦门翔安开发区。主要经营范围：矿产品（不含有色金属）利用技术研究、开发及检测，矿产品开发研究、技术咨询、信息服务。

●紫金博士后科研工作站：2001年经国家人事部全国博士后管委会批准设立，是全国黄金行业首家博士后科研工作站。公司为进站博士提出科研课题，进站博士亦可自行申请科研课题，公司按科研实际需要为经审批后的项目提供科研经费。除固定的协议年薪、以及享受国家规定的优惠待遇外，紫金博士后科研工作站进站博士还可享受同本单位正式员工一样的各种待遇，公司还按课题完成情况分阶段发放奖金，如有突出成果，公司将给予重奖。公司为博士后科研人员配置手提电脑、配备助手，如愿意加盟紫金工作，可为博士后解决户口的落户、子女就学、住房等实际问题。

紫金矿业集团每个下属公司、矿山及生产厂都设有相应的科研机构和配套的科研人员。